A história gira em torno de 4 meninas, Spencer (Troian Bellisario), Hanna (Ashley Benson), Aria (Lucy Hale) e Emily (Shay Mitchell) que se tornam amigas de Alison, a garota mais popular da escola. As cinco se tornam amigas inseparáveis e elas escondem um segredo em comum (somente conhecido por Alison) que se revelado, implicará a todas. Em um dia normal, Alison simplesmente desaparece e por causa deste segredo nenhuma delas fica realmente sentida com a perda. As quatro demais amigas vão lentamente se afastando, pois Alison era a "cola" que as mantinham juntas. Anos depois, cada uma das quatro amigas tem coisas diferentes acontecendo em suas vidas, assim como novos segredos que elas escondem de todos: Aria mantém uma relação com um de seus professores; Hanna passa o tempo roubando peças de roupas e acessórios em lojas famosas; Spencer mantém um caso com o namorado da irmã, e Emily se descobre atraída por outra colega de classe. As quatro voltam a se aproximar quando comecam a receber recados, emails, mensagens no celular de alguém que vê tudo, sabe de tudo e que se identifica apenas como "A".

Na segunda temporada, as liars são tachadas de mentirosas por toda Rosewood, já que ninguém acredita que Ian está morto. Aria é obrigada a lidar com alguém do passado de Ezra e com a revelação do relacionamento dos dois. Hanna segue com seu namoro com Caleb. Spencer e Toby ainda estão namorando a sério e Emily se torna o principal alvo de -A. O/A vilão/vilã da série está cada vez mais perigoso e deixa para trás as mensagens ameaçadoras, fazendo com que seu jogo de gato e rato se torne ainda mais direto e letal para as Liars. E pessoas que antes poderiam ser consideradas amigas, se tornaram inimigos muito suspeitos.

A terceira temporada começa seis meses depois que a identidade de -A foi revelada no final da temporada passada. As Liars pensavam que estavam livres e que o pesadelo havia acabado, mas há um novo -A em Rosewood, muito mais perigoso do que o anterior. O mistério da temporada gira em torno da morte de um grande personagem e o fato de Jenna ter recuperado sua visão a torna ainda mais suspeita. Aria e Ezra revelaram seu namoro para as pessoas de Rosewood, mas nem por isso as coisas serão mais fáceis. Os segredos de Hanna destroem seu relacionamento com Caleb, e a mesma coisa pode acontecer com Spencer e Toby. Enquanto isso, Emily precisa lidar com a morte de Maya. E um personagem que todos acreditavam ser do bem, acaba revelando-se como um grande traidor.

Pretty Dirty Secrets" está marcada para começar exatamente após a exibição do Summer Finale de Pretty Little Liars, "The Lady Killer", e vai acompanhar alguns dos mais misteriosos residentes de Rosewood enquanto se preparam para o Halloween. Após o último episódio da web série, será exibido o episódio especial da data – "This Is A Dark Ride" – no dia 23 de Outubro. A série também teve um especial de Halloween em 2011, onde as meninas estavam vestidas com fantasias (todos nós queremos as fantasias daquele episódio e sair pelo carnaval carioca) e esse ano não deve ser diferente (as fantasias sim).